Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsr1Q5SWD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr1Q5SWD9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsr1Q5SWD9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsr1Q5SWD9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsr1Q5SWD9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tsr1Q5SWD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tsr1Q5SWD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tsr1Q5SWD9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tsr1Q5SWD9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tsr1Q5SWD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsr1Q5SWD9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsr1Q5SWD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsr1Q5SWD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsr1Q5SWD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tsr1Q5SWD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr1Q5SWD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsr1Q5SWD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms