Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJG7

Ispd, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IspdQ5RJG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IspdQ5RJG7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IspdQ5RJG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IspdQ5RJG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IspdQ5RJG7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IspdQ5RJG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IspdQ5RJG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IspdQ5RJG7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IspdQ5RJG7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IspdQ5RJG7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IspdQ5RJG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IspdQ5RJG7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IspdQ5RJG7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IspdQ5RJG7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IspdQ5RJG7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IspdQ5RJG7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms