Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Kdm6bQ5NCY0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Kdm6bQ5NCY0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Kdm6bQ5NCY0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Kdm6bQ5NCY0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Kdm6bQ5NCY0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Kdm6bQ5NCY0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Kdm6bQ5NCY0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Kdm6bQ5NCY0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Kdm6bQ5NCY0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Kdm6bQ5NCY0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Kdm6bQ5NCY0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm6bQ5NCY0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm6bQ5NCY0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Kdm6bQ5NCY0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Kdm6bQ5NCY0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm6bQ5NCY0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Kdm6bQ5NCY0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Kdm6bQ5NCY0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Kdm6bQ5NCY0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Kdm6bQ5NCY0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Kdm6bQ5NCY0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Kdm6bQ5NCY0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Kdm6bQ5NCY0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Kdm6bQ5NCY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Kdm6bQ5NCY0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Kdm6bQ5NCY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Kdm6bQ5NCY0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Kdm6bQ5NCY0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Kdm6bQ5NCY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Kdm6bQ5NCY0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Kdm6bQ5NCY0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Kdm6bQ5NCY0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Kdm6bQ5NCY0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kdm6bQ5NCY0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm6bQ5NCY0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms