Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Kdm6bQ5NCY0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,42■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Kdm6bQ5NCY0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Kdm6bQ5NCY0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Kdm6bQ5NCY0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Kdm6bQ5NCY0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Kdm6bQ5NCY0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Kdm6bQ5NCY0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Kdm6bQ5NCY0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Kdm6bQ5NCY0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Kdm6bQ5NCY0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Kdm6bQ5NCY0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Kdm6bQ5NCY0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39,16■■■■□ 3,86
Kdm6bQ5NCY0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Kdm6bQ5NCY0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Kdm6bQ5NCY0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,08■■■■□ 3,85
Kdm6bQ5NCY0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39,07■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39,05■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39,02■■■■□ 3,84
Kdm6bQ5NCY0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Kdm6bQ5NCY0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Kdm6bQ5NCY0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Kdm6bQ5NCY0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Kdm6bQ5NCY0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Kdm6bQ5NCY0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,85■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,85■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,82■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38,82■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Kdm6bQ5NCY0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38,79■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38,78■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,76■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,76■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Kdm6bQ5NCY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38,69■■■■□ 3,78
Kdm6bQ5NCY0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Kdm6bQ5NCY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38,68■■■■□ 3,78
Kdm6bQ5NCY0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,67■■■■□ 3,78
Kdm6bQ5NCY0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Kdm6bQ5NCY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,62■■■■□ 3,77
Kdm6bQ5NCY0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Kdm6bQ5NCY0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Kdm6bQ5NCY0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Kdm6bQ5NCY0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Kdm6bQ5NCY0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38,48■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38,47■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38,46■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38,46■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Kdm6bQ5NCY0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Kdm6bQ5NCY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38,44■■■■□ 3,74
Kdm6bQ5NCY0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Kdm6bQ5NCY0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38,42■■■■□ 3,74
Kdm6bQ5NCY0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms