Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc1Q5NCF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc1Q5NCF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc1Q5NCF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc1Q5NCF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc1Q5NCF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms