Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Trpm3Q5F4S9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trpm3Q5F4S9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trpm3Q5F4S9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trpm3Q5F4S9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trpm3Q5F4S9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trpm3Q5F4S9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Trpm3Q5F4S9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trpm3Q5F4S9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm3Q5F4S9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Trpm3Q5F4S9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trpm3Q5F4S9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm3Q5F4S9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trpm3Q5F4S9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Trpm3Q5F4S9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Trpm3Q5F4S9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Trpm3Q5F4S9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trpm3Q5F4S9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trpm3Q5F4S9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm3Q5F4S9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trpm3Q5F4S9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trpm3Q5F4S9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trpm3Q5F4S9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trpm3Q5F4S9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trpm3Q5F4S9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trpm3Q5F4S9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trpm3Q5F4S9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Trpm3Q5F4S9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trpm3Q5F4S9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Trpm3Q5F4S9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trpm3Q5F4S9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trpm3Q5F4S9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Trpm3Q5F4S9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trpm3Q5F4S9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trpm3Q5F4S9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Trpm3Q5F4S9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trpm3Q5F4S9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trpm3Q5F4S9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trpm3Q5F4S9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trpm3Q5F4S9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms