Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,27■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
AY761185Q5ERI8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
AY761185Q5ERI8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23,24■■□□□ 1,31
AY761185Q5ERI8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
AY761185Q5ERI8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
AY761185Q5ERI8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
AY761185Q5ERI8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,21■■□□□ 1,31
AY761185Q5ERI8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,17■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,15■■□□□ 1,3
AY761185Q5ERI8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23,1■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
AY761185Q5ERI8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23,07■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23,05■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23,04■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
AY761185Q5ERI8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
AY761185Q5ERI8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22,95■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22,94■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22,93■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22,91■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
AY761185Q5ERI8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,87■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22,87■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
AY761185Q5ERI8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
AY761185Q5ERI8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22,76■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22,75■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22,74■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
AY761185Q5ERI8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
AY761185Q5ERI8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms