Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Trp53i11Q4QQM4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Trp53i11Q4QQM4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Trp53i11Q4QQM4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Trp53i11Q4QQM4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Trp53i11Q4QQM4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Trp53i11Q4QQM4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Trp53i11Q4QQM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms