Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc3lQ4KL14 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc3lQ4KL14 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc3lQ4KL14 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc3lQ4KL14 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc3lQ4KL14 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc3lQ4KL14 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc3lQ4KL14 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc3lQ4KL14 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc3lQ4KL14 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc3lQ4KL14 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc3lQ4KL14 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trappc3lQ4KL14 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc3lQ4KL14 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc3lQ4KL14 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc3lQ4KL14 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc3lQ4KL14 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc3lQ4KL14 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc3lQ4KL14 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc3lQ4KL14 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trappc3lQ4KL14 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trappc3lQ4KL14 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trappc3lQ4KL14 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc3lQ4KL14 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc3lQ4KL14 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Trappc3lQ4KL14 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc3lQ4KL14 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc3lQ4KL14 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc3lQ4KL14 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc3lQ4KL14 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trappc3lQ4KL14 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc3lQ4KL14 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc3lQ4KL14 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc3lQ4KL14 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc3lQ4KL14 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trappc3lQ4KL14 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms