Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp235Q499D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp235Q499D5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp235Q499D5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp235Q499D5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp235Q499D5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp235Q499D5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp235Q499D5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp235Q499D5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp235Q499D5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp235Q499D5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp235Q499D5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp235Q499D5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp235Q499D5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp235Q499D5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp235Q499D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp235Q499D5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp235Q499D5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp235Q499D5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp235Q499D5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp235Q499D5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp235Q499D5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp235Q499D5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp235Q499D5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp235Q499D5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp235Q499D5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp235Q499D5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms