Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec4Q497M3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec4Q497M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec4Q497M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec4Q497M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec4Q497M3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec4Q497M3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apobec4Q497M3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apobec4Q497M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apobec4Q497M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec4Q497M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec4Q497M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec4Q497M3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apobec4Q497M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apobec4Q497M3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms