Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrrc43Q3V0L5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrrc43Q3V0L5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrrc43Q3V0L5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrc43Q3V0L5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc43Q3V0L5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc43Q3V0L5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrc43Q3V0L5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrrc43Q3V0L5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrc43Q3V0L5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrc43Q3V0L5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrrc43Q3V0L5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrrc43Q3V0L5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrrc43Q3V0L5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrrc43Q3V0L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrrc43Q3V0L5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrrc43Q3V0L5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrc43Q3V0L5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrrc43Q3V0L5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrrc43Q3V0L5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrrc43Q3V0L5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrrc43Q3V0L5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lrrc43Q3V0L5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrrc43Q3V0L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrrc43Q3V0L5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrrc43Q3V0L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lrrc43Q3V0L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrrc43Q3V0L5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
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