Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
4933416C03RikQ3V063 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
4933416C03RikQ3V063 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
4933416C03RikQ3V063 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
4933416C03RikQ3V063 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
4933416C03RikQ3V063 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
4933416C03RikQ3V063 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
4933416C03RikQ3V063 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
4933416C03RikQ3V063 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
4933416C03RikQ3V063 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
4933416C03RikQ3V063 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
4933416C03RikQ3V063 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
4933416C03RikQ3V063 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
4933416C03RikQ3V063 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
4933416C03RikQ3V063 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
4933416C03RikQ3V063 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
4933416C03RikQ3V063 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
4933416C03RikQ3V063 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4933416C03RikQ3V063 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
4933416C03RikQ3V063 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
4933416C03RikQ3V063 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
4933416C03RikQ3V063 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
4933416C03RikQ3V063 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms