Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc160Q3UYG1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc160Q3UYG1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc160Q3UYG1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc160Q3UYG1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc160Q3UYG1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc160Q3UYG1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc160Q3UYG1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc160Q3UYG1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms