Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl4Q3URY0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtl4Q3URY0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl4Q3URY0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtl4Q3URY0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtl4Q3URY0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtl4Q3URY0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rtl4Q3URY0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms