Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp19Q3UJD6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp19Q3UJD6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Usp19Q3UJD6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Usp19Q3UJD6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Usp19Q3UJD6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp19Q3UJD6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp19Q3UJD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp19Q3UJD6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp19Q3UJD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp19Q3UJD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp19Q3UJD6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp19Q3UJD6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp19Q3UJD6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp19Q3UJD6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp19Q3UJD6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp19Q3UJD6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp19Q3UJD6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp19Q3UJD6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp19Q3UJD6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Usp19Q3UJD6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp19Q3UJD6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp19Q3UJD6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp19Q3UJD6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp19Q3UJD6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms