Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm648Q3UJ22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm648Q3UJ22 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm648Q3UJ22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm648Q3UJ22 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm648Q3UJ22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm648Q3UJ22 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm648Q3UJ22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm648Q3UJ22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms