Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc34Q3UI66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc34Q3UI66 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc34Q3UI66 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc34Q3UI66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc34Q3UI66 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc34Q3UI66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc34Q3UI66 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc34Q3UI66 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc34Q3UI66 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc34Q3UI66 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc34Q3UI66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc34Q3UI66 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc34Q3UI66 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms