Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Lmod2Q3UHZ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39,7■■■■□ 3,95
Lmod2Q3UHZ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,67■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,65■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Lmod2Q3UHZ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39,63■■■■□ 3,93
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Lmod2Q3UHZ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Lmod2Q3UHZ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
Lmod2Q3UHZ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39,57■■■■□ 3,93
Lmod2Q3UHZ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39,57■■■■□ 3,93
Lmod2Q3UHZ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Lmod2Q3UHZ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Lmod2Q3UHZ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Lmod2Q3UHZ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Lmod2Q3UHZ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Lmod2Q3UHZ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39,5■■■■□ 3,91
Lmod2Q3UHZ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,5■■■■□ 3,91
Lmod2Q3UHZ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Lmod2Q3UHZ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Lmod2Q3UHZ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Lmod2Q3UHZ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Lmod2Q3UHZ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Lmod2Q3UHZ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Lmod2Q3UHZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Lmod2Q3UHZ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Lmod2Q3UHZ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Lmod2Q3UHZ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39,32■■■■□ 3,89
Lmod2Q3UHZ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39,26■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39,26■■■■□ 3,88
Lmod2Q3UHZ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39,25■■■■□ 3,87
Lmod2Q3UHZ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Lmod2Q3UHZ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Lmod2Q3UHZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39,22■■■■□ 3,87
Lmod2Q3UHZ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Lmod2Q3UHZ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Lmod2Q3UHZ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Lmod2Q3UHZ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Lmod2Q3UHZ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Lmod2Q3UHZ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,17■■■■□ 3,86
Lmod2Q3UHZ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39,16■■■■□ 3,86
Lmod2Q3UHZ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39,13■■■■□ 3,85
Lmod2Q3UHZ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Lmod2Q3UHZ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Lmod2Q3UHZ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39,02■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,02■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Lmod2Q3UHZ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Lmod2Q3UHZ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Lmod2Q3UHZ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Lmod2Q3UHZ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Lmod2Q3UHZ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,97■■■■□ 3,83
Lmod2Q3UHZ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Lmod2Q3UHZ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38,93■■■■□ 3,82
Lmod2Q3UHZ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Lmod2Q3UHZ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Lmod2Q3UHZ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Lmod2Q3UHZ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Lmod2Q3UHZ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38,87■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38,85■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38,85■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Lmod2Q3UHZ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Lmod2Q3UHZ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Lmod2Q3UHZ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38,81■■■■□ 3,8
Lmod2Q3UHZ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Lmod2Q3UHZ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Lmod2Q3UHZ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Lmod2Q3UHZ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,2 ms