Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Lmod2Q3UHZ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Lmod2Q3UHZ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Lmod2Q3UHZ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Lmod2Q3UHZ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Lmod2Q3UHZ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Lmod2Q3UHZ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
Lmod2Q3UHZ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Lmod2Q3UHZ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Lmod2Q3UHZ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Lmod2Q3UHZ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Lmod2Q3UHZ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Lmod2Q3UHZ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Lmod2Q3UHZ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Lmod2Q3UHZ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Lmod2Q3UHZ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Lmod2Q3UHZ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Lmod2Q3UHZ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Lmod2Q3UHZ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Lmod2Q3UHZ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Lmod2Q3UHZ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Lmod2Q3UHZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Lmod2Q3UHZ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Lmod2Q3UHZ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lmod2Q3UHZ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Lmod2Q3UHZ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Lmod2Q3UHZ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lmod2Q3UHZ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Lmod2Q3UHZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lmod2Q3UHZ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lmod2Q3UHZ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lmod2Q3UHZ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lmod2Q3UHZ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lmod2Q3UHZ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Lmod2Q3UHZ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Lmod2Q3UHZ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Lmod2Q3UHZ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lmod2Q3UHZ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Lmod2Q3UHZ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Lmod2Q3UHZ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Lmod2Q3UHZ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lmod2Q3UHZ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Lmod2Q3UHZ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Lmod2Q3UHZ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Lmod2Q3UHZ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lmod2Q3UHZ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lmod2Q3UHZ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Lmod2Q3UHZ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Lmod2Q3UHZ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Lmod2Q3UHZ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Lmod2Q3UHZ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lmod2Q3UHZ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lmod2Q3UHZ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lmod2Q3UHZ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms