Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcrip1Q3UGS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcrip1Q3UGS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mcrip1Q3UGS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mcrip1Q3UGS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mcrip1Q3UGS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms