Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Yipf3Q3UDR8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Yipf3Q3UDR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Yipf3Q3UDR8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Yipf3Q3UDR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Yipf3Q3UDR8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf3Q3UDR8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf3Q3UDR8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yipf3Q3UDR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf3Q3UDR8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Yipf3Q3UDR8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Yipf3Q3UDR8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yipf3Q3UDR8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms