Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trafd1Q3UDK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trafd1Q3UDK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trafd1Q3UDK1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trafd1Q3UDK1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trafd1Q3UDK1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trafd1Q3UDK1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trafd1Q3UDK1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trafd1Q3UDK1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trafd1Q3UDK1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trafd1Q3UDK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trafd1Q3UDK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trafd1Q3UDK1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms