Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ttll12Q3UDE2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll12Q3UDE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ttll12Q3UDE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ttll12Q3UDE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ttll12Q3UDE2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ttll12Q3UDE2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ttll12Q3UDE2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ttll12Q3UDE2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttll12Q3UDE2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttll12Q3UDE2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ttll12Q3UDE2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ttll12Q3UDE2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ttll12Q3UDE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ttll12Q3UDE2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ttll12Q3UDE2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ttll12Q3UDE2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ttll12Q3UDE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ttll12Q3UDE2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ttll12Q3UDE2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ttll12Q3UDE2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ttll12Q3UDE2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ttll12Q3UDE2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ttll12Q3UDE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttll12Q3UDE2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttll12Q3UDE2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ttll12Q3UDE2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ttll12Q3UDE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ttll12Q3UDE2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms