Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Palb2Q3U0P1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Palb2Q3U0P1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Palb2Q3U0P1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Palb2Q3U0P1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Palb2Q3U0P1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Palb2Q3U0P1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Palb2Q3U0P1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Palb2Q3U0P1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Palb2Q3U0P1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Palb2Q3U0P1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Palb2Q3U0P1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Palb2Q3U0P1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Palb2Q3U0P1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Palb2Q3U0P1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Palb2Q3U0P1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Palb2Q3U0P1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Palb2Q3U0P1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Palb2Q3U0P1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Palb2Q3U0P1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Palb2Q3U0P1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Palb2Q3U0P1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Palb2Q3U0P1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Palb2Q3U0P1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Palb2Q3U0P1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Palb2Q3U0P1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms