Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrn4clQ3TYX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrn4clQ3TYX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrn4clQ3TYX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn4clQ3TYX2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrn4clQ3TYX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn4clQ3TYX2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrn4clQ3TYX2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrn4clQ3TYX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrn4clQ3TYX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms