Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdlim7Q3TJD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdlim7Q3TJD7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdlim7Q3TJD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdlim7Q3TJD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdlim7Q3TJD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdlim7Q3TJD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdlim7Q3TJD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdlim7Q3TJD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdlim7Q3TJD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdlim7Q3TJD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdlim7Q3TJD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdlim7Q3TJD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdlim7Q3TJD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pdlim7Q3TJD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdlim7Q3TJD7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdlim7Q3TJD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdlim7Q3TJD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdlim7Q3TJD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdlim7Q3TJD7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdlim7Q3TJD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdlim7Q3TJD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdlim7Q3TJD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdlim7Q3TJD7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms