Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2afvQ3THW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
H2afvQ3THW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
H2afvQ3THW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2afvQ3THW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H2afvQ3THW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H2afvQ3THW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H2afvQ3THW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2afvQ3THW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
H2afvQ3THW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H2afvQ3THW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H2afvQ3THW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2afvQ3THW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2afvQ3THW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H2afvQ3THW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2afvQ3THW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2afvQ3THW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2afvQ3THW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2afvQ3THW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2afvQ3THW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms