Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB92

Milr1, Allergin-1, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Milr1Q3TB92 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Milr1Q3TB92 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Milr1Q3TB92 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Milr1Q3TB92 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Milr1Q3TB92 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Milr1Q3TB92 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Milr1Q3TB92 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Milr1Q3TB92 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Milr1Q3TB92 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms