Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Gbp8Q2V6D6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gbp8Q2V6D6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gbp8Q2V6D6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gbp8Q2V6D6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,58■■□□□ 1,68
Gbp8Q2V6D6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gbp8Q2V6D6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gbp8Q2V6D6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gbp8Q2V6D6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gbp8Q2V6D6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Gbp8Q2V6D6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gbp8Q2V6D6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gbp8Q2V6D6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gbp8Q2V6D6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gbp8Q2V6D6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gbp8Q2V6D6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gbp8Q2V6D6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gbp8Q2V6D6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gbp8Q2V6D6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gbp8Q2V6D6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gbp8Q2V6D6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gbp8Q2V6D6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gbp8Q2V6D6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms