Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim71Q1PSW8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim71Q1PSW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim71Q1PSW8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim71Q1PSW8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim71Q1PSW8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim71Q1PSW8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim71Q1PSW8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim71Q1PSW8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim71Q1PSW8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim71Q1PSW8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim71Q1PSW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim71Q1PSW8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim71Q1PSW8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim71Q1PSW8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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