Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q149G0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q149G0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q149G0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q149G0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q149G0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q149G0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q149G0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Q149G0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q149G0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q149G0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q149G0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q149G0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q149G0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q149G0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q149G0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q149G0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Q149G0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q149G0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q149G0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q149G0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q149G0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q149G0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q149G0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q149G0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q149G0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q149G0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q149G0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q149G0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q149G0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q149G0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q149G0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q149G0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q149G0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q149G0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q149G0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q149G0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q149G0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Q149G0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q149G0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q149G0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q149G0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q149G0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q149G0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q149G0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q149G0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q149G0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q149G0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q149G0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q149G0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q149G0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q149G0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q149G0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q149G0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q149G0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q149G0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q149G0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q149G0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q149G0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q149G0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q149G0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q149G0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q149G0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q149G0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q149G0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q149G0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q149G0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q149G0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q149G0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q149G0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q149G0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q149G0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q149G0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q149G0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q149G0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q149G0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q149G0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q149G0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q149G0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q149G0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q149G0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q149G0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q149G0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q149G0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q149G0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q149G0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q149G0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q149G0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q149G0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q149G0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q149G0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q149G0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q149G0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q149G0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q149G0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q149G0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q149G0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q149G0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q149G0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q149G0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms