Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc162pQ0VG85 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc162pQ0VG85 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc162pQ0VG85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc162pQ0VG85 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc162pQ0VG85 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc162pQ0VG85 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc162pQ0VG85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc162pQ0VG85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc162pQ0VG85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc162pQ0VG85 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc162pQ0VG85 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc162pQ0VG85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc162pQ0VG85 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc162pQ0VG85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms