Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp2b3Q0VF55 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp2b3Q0VF55 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Atp2b3Q0VF55 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atp2b3Q0VF55 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp2b3Q0VF55 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Atp2b3Q0VF55 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp2b3Q0VF55 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Atp2b3Q0VF55 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp2b3Q0VF55 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atp2b3Q0VF55 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp2b3Q0VF55 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atp2b3Q0VF55 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp2b3Q0VF55 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp2b3Q0VF55 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp2b3Q0VF55 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp2b3Q0VF55 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp2b3Q0VF55 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms