Protein–RNA interactions for Protein: Q08351

Mpl, Thrombopoietin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MplQ08351 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MplQ08351 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MplQ08351 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MplQ08351 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MplQ08351 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MplQ08351 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MplQ08351 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MplQ08351 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MplQ08351 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MplQ08351 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MplQ08351 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MplQ08351 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MplQ08351 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MplQ08351 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MplQ08351 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MplQ08351 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MplQ08351 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MplQ08351 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MplQ08351 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MplQ08351 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MplQ08351 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MplQ08351 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MplQ08351 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MplQ08351 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MplQ08351 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MplQ08351 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MplQ08351 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MplQ08351 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MplQ08351 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MplQ08351 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MplQ08351 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MplQ08351 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MplQ08351 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MplQ08351 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MplQ08351 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MplQ08351 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MplQ08351 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MplQ08351 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MplQ08351 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MplQ08351 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MplQ08351 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MplQ08351 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MplQ08351 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MplQ08351 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MplQ08351 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MplQ08351 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MplQ08351 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MplQ08351 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MplQ08351 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MplQ08351 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MplQ08351 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MplQ08351 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MplQ08351 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MplQ08351 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MplQ08351 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MplQ08351 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MplQ08351 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MplQ08351 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MplQ08351 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MplQ08351 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MplQ08351 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MplQ08351 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MplQ08351 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MplQ08351 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MplQ08351 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MplQ08351 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MplQ08351 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MplQ08351 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MplQ08351 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MplQ08351 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MplQ08351 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MplQ08351 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MplQ08351 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MplQ08351 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MplQ08351 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MplQ08351 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MplQ08351 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MplQ08351 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MplQ08351 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MplQ08351 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MplQ08351 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MplQ08351 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MplQ08351 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MplQ08351 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MplQ08351 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MplQ08351 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MplQ08351 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MplQ08351 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MplQ08351 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MplQ08351 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MplQ08351 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MplQ08351 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MplQ08351 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MplQ08351 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MplQ08351 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MplQ08351 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MplQ08351 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MplQ08351 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MplQ08351 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MplQ08351 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms