Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calb2Q08331 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calb2Q08331 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calb2Q08331 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calb2Q08331 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calb2Q08331 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calb2Q08331 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb2Q08331 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb2Q08331 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms