Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ebf1Q07802 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ebf1Q07802 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ebf1Q07802 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ebf1Q07802 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ebf1Q07802 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ebf1Q07802 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ebf1Q07802 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ebf1Q07802 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ebf1Q07802 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ebf1Q07802 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ebf1Q07802 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ebf1Q07802 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ebf1Q07802 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ebf1Q07802 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ebf1Q07802 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ebf1Q07802 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf1Q07802 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms