Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf3Q07104 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf3Q07104 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf3Q07104 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf3Q07104 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf3Q07104 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf3Q07104 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdf3Q07104 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdf3Q07104 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf3Q07104 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf3Q07104 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf3Q07104 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf3Q07104 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf3Q07104 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf3Q07104 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf3Q07104 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf3Q07104 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf3Q07104 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf3Q07104 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms