Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tie1Q06806 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tie1Q06806 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tie1Q06806 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tie1Q06806 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tie1Q06806 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tie1Q06806 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tie1Q06806 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tie1Q06806 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tie1Q06806 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tie1Q06806 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tie1Q06806 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tie1Q06806 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tie1Q06806 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tie1Q06806 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tie1Q06806 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tie1Q06806 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tie1Q06806 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tie1Q06806 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tie1Q06806 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tie1Q06806 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tie1Q06806 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms