Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cab39Q06138 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cab39Q06138 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cab39Q06138 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cab39Q06138 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cab39Q06138 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cab39Q06138 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cab39Q06138 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cab39Q06138 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms