Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
PtprgQ05909 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37,4■■■■□ 3,58
PtprgQ05909 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
PtprgQ05909 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
PtprgQ05909 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
PtprgQ05909 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37,38■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,37■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37,33■■■■□ 3,57
PtprgQ05909 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37,32■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37,28■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
PtprgQ05909 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37,23■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,21■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,2■■■■□ 3,55
PtprgQ05909 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37,15■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
PtprgQ05909 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
PtprgQ05909 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37,11■■■■□ 3,53
PtprgQ05909 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,1■■■■□ 3,53
PtprgQ05909 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37,1■■■■□ 3,53
PtprgQ05909 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
PtprgQ05909 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,98■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
PtprgQ05909 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
PtprgQ05909 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
PtprgQ05909 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
PtprgQ05909 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
PtprgQ05909 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
PtprgQ05909 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36,82■■■■□ 3,48
PtprgQ05909 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
PtprgQ05909 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
PtprgQ05909 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
PtprgQ05909 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36,76■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36,71■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36,7■■■■□ 3,47
PtprgQ05909 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36,69■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36,67■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36,65■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
PtprgQ05909 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
PtprgQ05909 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
PtprgQ05909 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
PtprgQ05909 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
PtprgQ05909 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,57■■■■□ 3,44
PtprgQ05909 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
PtprgQ05909 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36,56■■■■□ 3,44
PtprgQ05909 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms