Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col10a1Q05306 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col10a1Q05306 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col10a1Q05306 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col10a1Q05306 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col10a1Q05306 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col10a1Q05306 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col10a1Q05306 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col10a1Q05306 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col10a1Q05306 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col10a1Q05306 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col10a1Q05306 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col10a1Q05306 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col10a1Q05306 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col10a1Q05306 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col10a1Q05306 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col10a1Q05306 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms