Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox13Q04891 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox13Q04891 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox13Q04891 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox13Q04891 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox13Q04891 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox13Q04891 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox13Q04891 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox13Q04891 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox13Q04891 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms