Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top1Q04750 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1Q04750 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1Q04750 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1Q04750 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Top1Q04750 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top1Q04750 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top1Q04750 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top1Q04750 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top1Q04750 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top1Q04750 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Top1Q04750 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top1Q04750 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Top1Q04750 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Top1Q04750 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top1Q04750 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top1Q04750 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top1Q04750 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top1Q04750 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Top1Q04750 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms