Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crisp3Q03402 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crisp3Q03402 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Crisp3Q03402 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Crisp3Q03402 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Crisp3Q03402 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Crisp3Q03402 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Crisp3Q03402 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Crisp3Q03402 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Crisp3Q03402 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Crisp3Q03402 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Crisp3Q03402 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Crisp3Q03402 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Crisp3Q03402 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Crisp3Q03402 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms