Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msx2Q03358 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msx2Q03358 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msx2Q03358 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Msx2Q03358 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msx2Q03358 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msx2Q03358 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msx2Q03358 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx2Q03358 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msx2Q03358 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx2Q03358 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msx2Q03358 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msx2Q03358 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx2Q03358 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms