Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp11Q02853 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp11Q02853 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp11Q02853 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp11Q02853 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp11Q02853 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp11Q02853 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmp11Q02853 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp11Q02853 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp11Q02853 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms