Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gbp1Q01514 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gbp1Q01514 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gbp1Q01514 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gbp1Q01514 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gbp1Q01514 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gbp1Q01514 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gbp1Q01514 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gbp1Q01514 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gbp1Q01514 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbp1Q01514 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbp1Q01514 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbp1Q01514 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gbp1Q01514 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gbp1Q01514 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gbp1Q01514 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gbp1Q01514 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gbp1Q01514 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gbp1Q01514 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gbp1Q01514 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gbp1Q01514 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gbp1Q01514 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gbp1Q01514 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbp1Q01514 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms