Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Rbp1Q00915 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rbp1Q00915 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Rbp1Q00915 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rbp1Q00915 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rbp1Q00915 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,7■■□□□ 1,55
Rbp1Q00915 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rbp1Q00915 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,64■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Rbp1Q00915 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Rbp1Q00915 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rbp1Q00915 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Rbp1Q00915 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Rbp1Q00915 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rbp1Q00915 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rbp1Q00915 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Rbp1Q00915 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rbp1Q00915 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,5 ms