Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Serpina1cQ00896 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Serpina1cQ00896 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Serpina1cQ00896 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Serpina1cQ00896 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Serpina1cQ00896 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Serpina1cQ00896 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Serpina1cQ00896 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Serpina1cQ00896 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Serpina1cQ00896 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Serpina1cQ00896 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Serpina1cQ00896 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Serpina1cQ00896 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Serpina1cQ00896 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Serpina1cQ00896 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Serpina1cQ00896 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Serpina1cQ00896 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Serpina1cQ00896 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms