Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou1f1Q00286 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou1f1Q00286 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou1f1Q00286 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou1f1Q00286 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou1f1Q00286 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou1f1Q00286 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pou1f1Q00286 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou1f1Q00286 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou1f1Q00286 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou1f1Q00286 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 374 ms