Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlbpP97440 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlbpP97440 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlbpP97440 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SlbpP97440 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlbpP97440 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlbpP97440 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlbpP97440 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SlbpP97440 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlbpP97440 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlbpP97440 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlbpP97440 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SlbpP97440 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlbpP97440 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlbpP97440 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SlbpP97440 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlbpP97440 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlbpP97440 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlbpP97440 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlbpP97440 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlbpP97440 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SlbpP97440 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms